Kerjasama dan aliansi merupakan salah satu strategi dalam mewujudkan Puslitbang Kesos agar "selangkah lebih awal" dalam memberikan kontribusi nyata berupa hasil-hasil penelitian sebagai bahan dalam penyusunan kebijakan. Berbagai kerjasama telah dan sedang dilakukan selama ini. Kerjasama yang telah dibangun yaitu dengan:
- Badan Litbang HAM Kementerian Hukum dan HAM RI
- Lembaga Ilmu Pengetahuan Indonesia
- Kementerian Riset dan Teknologi
- Kementerian Kehutanan
- Kementerian Luar Negeri
- Badan Pusat Statistik
- Lembaga Admistrasi Negara
- Unicef
- Perguruan Tinggi Negeri maupun Swasta
- Pemerintah Daerah
- Badan Penelitian dan Pengembangan Daerah (Balitbangda)
- Lembaga Swadaya Masyarakat
- Media Massa baik cetak maupun elektronik
- Forum Komunikasi Kelitbangan (FKK)
